Somos un centro de investigación que basa su trabajo en la metodología de investigación-acción-participativa (IAP).  La cual consiste en:

• Sistematizar la experiencia local y organiza el análisis colectivo;
• Enlaza el análisis con la reflexión y  la acción, organiza las experiencias, percepciones y hechos para generar nuevos aprendizajes y conocimientos;
• Convierte a las personas de comunidades excluidas en investigadores y agentes de cambio.

A través de nuestras investigaciones y capacitación técnica que desde el CEGSS efectuamos para impactar en las siguientes áreas:

• Democratización del conocimiento,
• fortalecimiento de la gobernanza democrática del sistema de salud,
• promover la transparencia y
• La rendición de cuentas de las instituciones del Estado y promover la participación ciudadana.

En el CEGSS la investigación y la publicación de los hallazgos son únicamente componentes de un proceso amplio que incluye:

• La transferencia de conocimiento generada por la investigación hacia los grupos de población que son afectados directamente por los problemas investigados
• La implementación de procesos de desarrollo de capacidades hacia  organizaciones comunitarias para usar la evidencia/conocimiento en sus procesos de movilización social  y
• La implementación de procesos estratégicos de incidencia política.  En adición a lo anterior,  todos los temas que investiga el CEGSS surge del interés y demanda de las organizaciones comunitarias  con las que el CEGSS colabora.